O laboratório foi idealizado em 1992 através de um projeto de união ainda dentro da Universidade Federal de Ouro Preto em Minas Gerais, onde seus atuais sócios fundadores, Dra. Shirley Guimarães e Dr Mario Gontijo ainda eram estudantes e tinham a convicção de edificar e fomentar o projeto de uma rede laboratorial em uma região do país que fosse carente no setor e que agregasse valores do aporte de crescimento empresarial e de desenvolvimento social para seu entorno. A sociedade nasceu dos dois colegas, de faculdade Farmacêuticos-Bioquímicos.

Após vasta pesquisa de mercado,  a cidade de Eunápolis foi escolhida  como centro do polo regional para construção da primeira unidade da rede que seria a unidade matriz e as obras iniciaram em 1998. O moderno prédio foi concebido com estrutura para acolher o crescimento do projeto e sua expansão pelos futuros 20 anos. Desde sua abertura, o laboratório se preocupou com o social e assumiu  projetos sociais no setor de Educação e vulnerabilidade social  como diretrizes importantes para a sociedade.

Ao longo dos anos, o laboratório obteve seu reconhecimento social, empresarial, qualitativo  e  de prestador de serviços a comunidade que mais tarde viriam transformar a vida de toda uma região. Os sócios diretores vieram com preparo cientifico diferenciado para transformar a essencialidade em tradição e confiança da população baiana. Dra. Shirley Guimarães, implantou o primeiro serviço de citopatologia oncótica da cidade de Eunápolis e Região, e Dr. Mario Gontijo implantou e fundou a hemoterapia com a implantação e inauguração  do Banco de Sangue (Hemocentro de Eunápolis) que serve a todos hospitais da costa do descobrimento.

Vocacionados a aprimorar o serviços de apoio diagnósticos, em 2001 foi montado o primeiro serviço 24 horas de exames e atendimento hospitalar e junto com a hemoterapia e a rotina da qualidade foi se tornando a cultura do laboratório em sua primeira projeção de unidade na cidade Mater do Brasil com a abertura  em Santa Cruz Cabrália de sua primeira unidade avançada , em 2001 sendo a primeira unidade externa da rede . A partir desta, outras unidades avançavam por toda região como Itabela, Guaratinga, Porto Seguro bem como,  outras unidades na cidade de Eunápolis.

Em 2005 , o grupo Gontijo teve sua qualidade reconhecida internacionalmente, através da certificação ISO9001 , sendo o laboratório vanguarda do SUL DA BAHIA mais uma vez, sendo o primeiro a implantar e ser reconhecido pela sua qualidade por órgãos internacionais.

Durante este tempo, os sócios do laboratório sempre participaram das atividades cientificas e  sociais da cidade que crescia e fornecia mais serviços de saúde, pois ambos, aprovados em concurso público municipal, ajudaram com sua força de trabalho a fundar e expandir o DST AIS, hoje SAE –CTA e o CAPs- Centro Atenção Psicossocial, bem como o centro regional de Hemoterapia HEMOBA em 2004. Com ativismo na saúde, Dr Mario Gontijo, também professor da Faculdade Unesulbahia ate 2015, ocupou  cargos  de gestão na saúde municipal e regional com a liderança para realizar e fomentar outras transformações na região de saúde, implementando serviços no sistema SUS de imagem diagnóstico como ultrassom e tomografia computadorizada e a Unidade de Terapia Intensiva-UTI no maior hospital da cidade. Neste tempo, a diretriz principal do grupo Gontijo, teve na gestão da Dra. Shirley Guimarães o preparo da rede com implementações tecnológicas do mais moderno sistema informatizado e da robotização do setor produtivo,  implementando a conectividade do software com setores científicos e administrativo em toda a rede, bem como organizou o preparo da rede para continuar qualificando no segmento de mercado pretendido. O Laboratório Gontijo Guimarães, tem em seu corpo clínico, bioquímicos qualificados e preparados bem como parcerias médicas de especialidades que são únicas na região da costa do descobrimento como medicina hematológica e a patologia clínica.